Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms