Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Sox10Q04888 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sox10Q04888 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sox10Q04888 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sox10Q04888 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sox10Q04888 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sox10Q04888 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sox10Q04888 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sox10Q04888 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sox10Q04888 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sox10Q04888 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sox10Q04888 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sox10Q04888 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sox10Q04888 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox10Q04888 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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