Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Msx2Q03358 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms