Protein–RNA interactions for Protein: P84444

Ccl21a, C-C motif chemokine 21a, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21aP84444 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ccl21aP84444 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ccl21aP84444 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ccl21aP84444 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21aP84444 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21aP84444 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21aP84444 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21aP84444 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21aP84444 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21aP84444 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21aP84444 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21aP84444 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21aP84444 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21aP84444 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21aP84444 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21aP84444 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21aP84444 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21aP84444 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21aP84444 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21aP84444 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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