Protein–RNA interactions for Protein: P63139

Nfyb, Nuclear transcription factor Y subunit beta, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfybP63139 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NfybP63139 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NfybP63139 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NfybP63139 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NfybP63139 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NfybP63139 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NfybP63139 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NfybP63139 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NfybP63139 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NfybP63139 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NfybP63139 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NfybP63139 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NfybP63139 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NfybP63139 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NfybP63139 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NfybP63139 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NfybP63139 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NfybP63139 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms