Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms