Protein–RNA interactions for Protein: P56473

Agrp, Agouti-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrpP56473 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AgrpP56473 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
AgrpP56473 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AgrpP56473 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms