Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FmodP50608 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FmodP50608 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FmodP50608 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FmodP50608 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FmodP50608 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FmodP50608 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FmodP50608 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FmodP50608 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FmodP50608 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FmodP50608 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FmodP50608 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FmodP50608 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FmodP50608 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FmodP50608 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FmodP50608 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FmodP50608 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FmodP50608 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FmodP50608 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms