Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TtlP38585 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtlP38585 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms