Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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