Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms