Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

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Length 739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vcam1P29533 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vcam1P29533 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms