Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrgP28705 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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RxrgP28705 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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RxrgP28705 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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RxrgP28705 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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RxrgP28705 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrgP28705 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrgP28705 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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RxrgP28705 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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RxrgP28705 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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RxrgP28705 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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RxrgP28705 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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RxrgP28705 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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RxrgP28705 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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RxrgP28705 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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RxrgP28705 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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RxrgP28705 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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