Protein–RNA interactions for Protein: P20334

Tnfrsf9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf9P20334 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf9P20334 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf9P20334 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf9P20334 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf9P20334 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf9P20334 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf9P20334 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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