Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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