Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igsf6P0C6B7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms