Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zmat3O54836 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms