Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
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Prrt1O35449 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms