Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq1O09165 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms