Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20878L7N244 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms