Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm21310J3QQ23 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm21310J3QQ23 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm21310J3QQ23 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm21310J3QQ23 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm21310J3QQ23 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm21310J3QQ23 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm21310J3QQ23 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm21310J3QQ23 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm21310J3QQ23 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm21310J3QQ23 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm21310J3QQ23 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Gm21310J3QQ23 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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