Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cttnbp2B9EJA2 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cttnbp2B9EJA2 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cttnbp2B9EJA2 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cttnbp2B9EJA2 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cttnbp2B9EJA2 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cttnbp2B9EJA2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cttnbp2B9EJA2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cttnbp2B9EJA2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cttnbp2B9EJA2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 563 ms