Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Rtf1A2AQ19 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms