Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Lcn6A2AJB9 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Lcn6A2AJB9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Lcn6A2AJB9 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Lcn6A2AJB9 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Lcn6A2AJB9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Lcn6A2AJB9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Lcn6A2AJB9 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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