Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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