Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Cldn13Q9Z0S4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Cldn13Q9Z0S4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn13Q9Z0S4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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