Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms