Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms