Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESZ8

Gtf2i, General transcription factor II-I, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2iQ9ESZ8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2iQ9ESZ8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2iQ9ESZ8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2iQ9ESZ8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2iQ9ESZ8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2iQ9ESZ8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2iQ9ESZ8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2iQ9ESZ8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2iQ9ESZ8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2iQ9ESZ8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2iQ9ESZ8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2iQ9ESZ8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2iQ9ESZ8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2iQ9ESZ8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2iQ9ESZ8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2iQ9ESZ8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2iQ9ESZ8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2iQ9ESZ8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2iQ9ESZ8 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2iQ9ESZ8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2iQ9ESZ8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2iQ9ESZ8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2iQ9ESZ8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms