Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
OtofQ9ESF1 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms