Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms