Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms