Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms