Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rexo2Q9D8S4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rexo2Q9D8S4 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms