Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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Gtf3c6Q9D8P7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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Gtf3c6Q9D8P7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Gtf3c6Q9D8P7 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Gtf3c6Q9D8P7 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Gtf3c6Q9D8P7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Gtf3c6Q9D8P7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Gtf3c6Q9D8P7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Gtf3c6Q9D8P7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c6Q9D8P7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Gtf3c6Q9D8P7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Gtf3c6Q9D8P7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c6Q9D8P7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c6Q9D8P7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c6Q9D8P7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c6Q9D8P7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c6Q9D8P7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c6Q9D8P7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c6Q9D8P7 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c6Q9D8P7 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c6Q9D8P7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c6Q9D8P7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gtf3c6Q9D8P7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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