Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.9 ms