Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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Ccdc47Q9D024 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Ccdc47Q9D024 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ccdc47Q9D024 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ccdc47Q9D024 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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