Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms