Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Higd2aQ9CQJ1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms