Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms