Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Znf628Q8CJ78 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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Znf628Q8CJ78 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Znf628Q8CJ78 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Znf628Q8CJ78 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Znf628Q8CJ78 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Znf628Q8CJ78 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Znf628Q8CJ78 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Znf628Q8CJ78 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Znf628Q8CJ78 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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Znf628Q8CJ78 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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Znf628Q8CJ78 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Znf628Q8CJ78 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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