Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Rab11fip3Q8CHD8 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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