Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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