Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Gm20852-202ENSMUST00000188011 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atad2Q8CDM1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atad2Q8CDM1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atad2Q8CDM1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atad2Q8CDM1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atad2Q8CDM1 Mterf1a-201ENSMUST00000044746 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atad2Q8CDM1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atad2Q8CDM1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atad2Q8CDM1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atad2Q8CDM1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atad2Q8CDM1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atad2Q8CDM1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atad2Q8CDM1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atad2Q8CDM1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atad2Q8CDM1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atad2Q8CDM1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atad2Q8CDM1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atad2Q8CDM1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atad2Q8CDM1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atad2Q8CDM1 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atad2Q8CDM1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms