Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ubash3bQ8BGG7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ubash3bQ8BGG7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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