Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms