Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms