Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
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