Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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PtprdQ64487 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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PtprdQ64487 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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PtprdQ64487 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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