Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gja3Q64448 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja3Q64448 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja3Q64448 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gja3Q64448 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gja3Q64448 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja3Q64448 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja3Q64448 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gja3Q64448 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gja3Q64448 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja3Q64448 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gja3Q64448 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gja3Q64448 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja3Q64448 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja3Q64448 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja3Q64448 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gja3Q64448 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja3Q64448 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja3Q64448 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja3Q64448 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja3Q64448 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja3Q64448 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja3Q64448 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms